木叶建立之后，理所应当的便是要确认谁才是火影了。

在筛选首任火影之时，柱间原本打算让斑来当火影，但却遭到弟弟扉间的极大反对，之后扉间为哥哥柱间讲述了写轮眼的本质。不断提醒柱间不要过于天真：无论如何，火影大位一定会是民选，而普遍民意是推举柱间为火影。宇智波作为最后投降千手的宗族，在木叶的势力也是无法和千手相比即便是宇智波一族也没多少人信任宇智波斑。

实际上宇智波斑早已被木叶所有的族群孤立了起来。除了柱间支持斑做火影，其余木叶隐村所有族群的村民都支持柱间来做火影。

兄弟二人这一番话被宇智波斑听到，一片“木叶”也被斑丢弃在窗口

就这样，柱间成为了火之国木叶隐村的初代目火影，弟弟扉间成为了柱间的左膀右臂。为防止柱间过于天真、对人总是过于宽容造成一些对村子不利的事，因此，火影的大权掌握在弟弟扉间的手中。

柱间在位期间，扉间和他是完美搭档，他们之间的组合，一个拥有绝对的实力和美好的畅想，一个拥有将其实现的头脑。

挽回行动

在斑离开村子之际，柱间对宇智波斑百般挽留，他告诉斑他视斑为火影的左膀右臂，是柱间的兄弟，希望斑能够辅佐他，总有一天民众会发现斑的优点，到时候斑就是第二代火影，然而斑早就预料到在千手柱间死后继承火影大位的绝对是千手扉间，那样宇智波一族有朝一日必定会被抹杀，斑明白这点，所以号召宇智波族人跟自己离开村子，却没有一个人愿意追随斑。斑清楚除了柱间没有人能和他坦诚相待。随后斑询问柱间愿意为了村子割舍扉间还是斑，柱间犹豫了，因为斑足够了解柱间，知道这是柱间的底线，因此，宇智波斑坚持离开木叶，寻找自己想要的“真正的和平”。后来斑人间蒸发，没有人再听到过他的消息。

接着，在初步建立五大国之后，为解决讨论尾兽分配问题，柱间邀请各国四影参与史上前所未有的“第一次五影大会”，期间由弟弟扉间担任柱间的护卫。

在会议中柱间听从弟弟扉间以金钱换尾兽的提议，将九个尾兽平均分配给五大国，因此，使五影缔结了忍界第一份和平协议，在这片土地上第一次实现了全面和平。

但这份和平是有期限的，那就是柱间的寿命，一旦柱间死去，各国没有了顾忌，第一次忍界大战也就爆发了。

若干年后，斑突然回来向木叶发起袭击，斑企图摧毁自己曾经与柱间一起建立的村子，柱间为了保护村子挺身而出与斑展开激烈的对战。斑利用写轮眼的强大瞳力操纵着尾兽中战斗力最强的九尾与千手柱间决斗，而千手柱间则以仙人模式下的木遁忍术与之应战。

这场惊天动地的战斗后来被刻印在世人的记忆中，夜以继日的战斗改变了战场的地形。最后柱间终于将斑击败，并杀死曾经的朋友，暂时守护木叶的和平，这个大峡谷在后来都被世人称为终结之谷。

木叶为了纪念此次大战为二人建造了屹立在终结之谷两岸的雕像。

柱间遭到泷隐村精英忍者角都的暗杀，柱间以木遁秘术轻松压制角都，并让角都陷入苦战，由于柱间心慈手软，因此放过了角都。

当然，火影之中并没有明却说明柱间的死因，但纲手曾说。柱间与扉间两人都是为了保护村子牺牲。

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